防潮濕
碳酸氫銨易吸濕，造成氮揮發損失；硝酸銨吸濕性很強，易結塊（kuài）、潮解（jiě）；石灰氮和過磷酸（suān）鈣吸（xī）濕後易結塊，影（yǐng）響施用效果。因此，這些化肥應存放（fàng）在幹燥、陰涼（liáng）處，尤其碳酸氫銨儲存時包裝要密封牢固，避免與空氣接觸。
防揮（huī）發
氨水（shuǐ）、碳酸氫銨極易揮發（fā），儲存時要密封。氮素化肥、過磷酸鈣嚴禁與堿性物質（zhì）（石灰、草木灰等）混合堆放，以防氮素化肥揮發損（sǔn）失和降低磷肥的肥效（xiào）。
防受熱（rè）
溫度愈（yù）高，化肥的潮解揮發和結（jié）塊愈嚴重（穩定性（xìng）愈差），因此貯存房屋的（de）溫度應保持在30℃以下，農村（cūn）好（hǎo）不放在有（yǒu）熱源的廚房內。
防火災
硝酸銨、硝酸鉀等有助（zhù）燃性，貯存時不能和易燃物如煤油、汽油（yóu）、秸稈（gǎn）、木屑等堆放在一起，以免引（yǐn）起火災。
防爆炸
硝酸銨、硝酸鉀等容易爆炸，若與銅、鐵等金屬粉（fěn）末混（hún）在一起，一旦摩擦撞擊，就會引起（qǐ）爆（bào）炸事故。所以這些化肥結塊硬化後，嚴禁用金屬物猛擊，要用重物碾碎。
防腐蝕
過磷酸鈣有腐蝕性，應防止與皮膚、金屬器具接（jiē）觸（chù）；氨水（shuǐ）對銅、鐵有（yǒu）強烈（liè）腐蝕性，宜儲存於陶瓷、塑料、木製容器中。此外（wài），化肥不能與種子堆放在一起，也不（bú）要用（yòng）化肥袋（dài）裝種（zhǒng）子，以免影響種子發芽。
防混放
化肥有酸性（xìng）和堿（jiǎn）性，應分門別類，按（àn）產（chǎn）地、種類、性質分別放（fàng）置和保管，以免降低肥（féi）效（xiào）。
防誤用
肥料不能和農藥、人畜藥品、食用物品（如白糖、食鹽）等混放，以免誤（wù）用。特別要（yào）防（fáng）止小孩誤（wù）食。